Il museo espone numerosi ed importantissimi reperti relativi all’insediamento greco di Pithecusae, fondato nel secondo quarto dell’VIII secolo a.C. da Greci provenienti dall’isola di Eubea, recuperati grazie agli scavi condotti ad Ischia da Giorgio Buchner a partire dal 1952. Dopo una sezione destinata ad illustrare la rete delle relazioni commerciali che i Pithecusani svilupparono con il Vicino Oriente e Cartagine, la Grecia e la Spagna, l’Etruria meridionale, sino alla Puglia, alla Calabria ionica ed alla Sardegna, l’esposizione prosegue presentando parte dei corredi funerari della necropoli ubicata nella valle di San Montano ed usata come luogo di sepoltura per un millennio, a partire dalla metà dell’VIII secolo a.C.Provengono dalla necropoli i celebri vasi pithecusani, dal cratere tardo-geometrico di produzione locale decorato con scena di naufragio, alla famosa tazza da Rodi sulla quale fu inciso dopo la cottura, dunque sicuramente a Pithecusae, in alfabeto euboico è da ricordare a questo proposito che l’alfabeto rappresenta uno dei tasselli fondamentali del patrimonio di conoscenze che le popolazioni dell’Italia centrale mutuarono dai Greci di Pithecusae è un epigramma in tre versi che allude alla celebre coppa di Nestore descritta nell’Iliade. Già agli inizi del VII secolo a.C., per motivi politici legati allo sviluppo della colonia di Cuma sulla terraferma, si registra un progressivo declino dell’importanza di Pithecusae.